自理報檢單位的義務有：
    1.遵守國家有關法律、法規和檢驗檢疫規章，對報檢的真實性負責；
    2.自理報檢單位開展自理報檢的，應當按檢驗檢疫機構的要求選用報檢員，由報檢員憑檢驗檢疫機構核發的《報檢員證》辦理報檢手續；
    3.提供正確、齊全、合法、有效的證單，完整、準確、清楚地填制報檢單，并在規定的時間和地點辦理報檢手續；
    4.自理報檢單位在辦理報檢手續后，應當按要求及時與檢驗檢疫機構聯系工作，協助檢驗檢疫工作人員進行現場檢驗檢疫、抽（采）樣及檢驗檢疫處理等事宜并提供必要的工作條件；
    5.對已經檢驗檢疫合格放行的出口貨物應加強批次管理，不得錯發、錯運、漏發，以免造成貨證不符。對入境的法定檢驗檢疫貨物，未經檢驗檢疫合格或未經檢驗檢疫機構許可，不得銷售、使用或拆卸、運遞；
    6.申請檢驗檢疫、鑒定等工作
時，應按法律法規規定繳納檢驗檢疫費。