ATA單證冊制度的核心是實行暫準進口貨物的國際聯保。這種聯保形式的運作是通過國際商會國際局（IBCC）組織管理的國際擔保連環系統（又稱ATA/IBCC連環擔保系統）進行。這個系統由各國經海關當局核準的國際商會組織作為國家擔保機構共同組成。各國的擔保機構負責簽發本國申請的ATA單證冊，并對ATA單證冊項下的貨物應付的關稅及其他稅費向IBCC履行全面擔保義務。ATA單證冊的持證人在貨物出境前向本國ATA擔保機構申請簽發ATA單證冊后，憑此于有關入境時向該國海關申報，并按規定復運出境。如貨物在暫準進口期限屆滿時仍未復運出境，則進口國海關當局可在期滿后一年內向本國的ATA擔保機構提出索賠，要求支付該ATA單證冊項下進口貨物應付的進口稅款，該國擔保機構根據海關當局的索賠要求支付稅款后，再通過IBCC向該ATA單證冊簽發國的擔保機構追償已付的稅款。ATA單證冊的簽發和擔保由各國擔保商會負責，每個國家只能有一個擔保商會，擔保商會有權指定多個國內出證機構，并對下屬出證機構簽發的ATA單證冊承擔擔保責任。國際商會國際局負責對世界范圍內ATA單證冊制度進行日常管理。在我國，經國務院批準、海關總署授權，中國國際貿易促進委員會/中國國際商會是我國ATA單證冊的出證和擔保商會。負責我國ATA單證冊的簽發和擔保工作。根據海關對一般暫準進出口貨物監管的要求，暫時進出口貨物應事先向海關提供擔保，然后憑擔保辦理貨物的進出口通關。在這種情況下，當一批貨物多次發生暫時進出境行為時，有關的海關手續將變得繁瑣。而ATA單證冊的運作簡化了有關暫進出口貨物的通關手續，節約持證人通關費用與時間，降低持證人的管理風險，提高了海關管理的效率。