邊境小額貿易企，根據外經貿部統一規定的經營資格、條件以及在核定的企業總數內，由各邊境省、自治區自行審批。邊境小額貿易企業名錄須報外經貿部核準，并抄報國務院有關部門備案。未按規定批準并報備案的企業，一律不得經營邊境小額貿易。開展邊境小額貿易原則上不受貿易方式和經營分工限制。

允許邊境省自治區各指定1至2家邊境小額貿易企業，通過指定邊境口岸，經營向中國陸地邊境毗鄰國家出口邊境地區自產的國家指定公司聯合統一經營的商品，以及進口國家實行核定公司經營的進口商品。經營企業名單需報經外經貿部核準。

邊境小額貿易企業凡出口國家實行配額、許可證管理的出口商品，除實行全國統一招標、統一聯合經營的商品和軍民通用化學品及易制毒化學品外，可免領配額、許可證，但要接受外經貿部和國家計委的宏觀管理。在外經貿部切塊下達的指標內，海關憑企業出口合同和各邊境省、自治區外經貿管理部門下達的文件驗放。

國家計委、國家經貿委（國家機電產品進出口辦公室）每年根據上年度邊境小額貿易進口情況和國內市場供求情況，專項給各邊境地區下達一定數額的邊境小額貿易進口配額。在核準的配額內，由外經貿部授權各邊境省、自治區外經貿管理部門發放進口許可證。邊境小額貿易企業凡進口國家實行配額管理的進口商品，海關憑邊境省、自治區發放的配額證明和進口許可證放行。對邊境小額貿易企業經營實行特定管理和登記管理的進口商品，也要適當簡化手續，具體辦法由國家計委、國家經貿委（國家機電產品進出口辦公室）分別商有關部門制定下達。