近年來，隨著加工貿(mào)易的不斷發(fā)展，在部分加工貿(mào)易環(huán)節(jié)，2004年發(fā)布的《中華人民共和國海關(guān)對加工貿(mào)易貨物監(jiān)管辦法》（以下簡稱“《辦法》”）已經(jīng)不能完全適應(yīng)海關(guān)保稅監(jiān)管工作需要。因此，為保證海關(guān)監(jiān)管能夠更加有效地實施，保證《辦法》內(nèi)容適應(yīng)海關(guān)保稅監(jiān)管業(yè)務(wù)的發(fā)展，有必要對《辦法》的部分條文進行修改。
由于此次修改的內(nèi)容不多，涉及的條文共5條，因此采取了修改決定的形式進行修改。

取消了“主要工序”不得外發(fā)加工的限制

具體體現(xiàn)在對《辦法》第三條、第二十三條和第二十五條的修改上。
《辦法》原第三條對“外發(fā)加工”作了定義：“外發(fā)加工，是指加工貿(mào)易企業(yè)因受自身生產(chǎn)工序限制，經(jīng)海關(guān)批準(zhǔn)并辦理有關(guān)手續(xù)，委托承攬企業(yè)對加工貿(mào)易貨物的某道工序進行加工，在規(guī)定期限內(nèi)將加工后的產(chǎn)品運回本企業(yè)并最終復(fù)出口的行為。”
現(xiàn)將其修改為：“外發(fā)加工，是指經(jīng)營企業(yè)因受自身生產(chǎn)特點和條件限制，經(jīng)海關(guān)批準(zhǔn)并辦理有關(guān)手續(xù)，委托承攬企業(yè)對加工貿(mào)易貨物進行加工，在規(guī)定期限內(nèi)將加工后的產(chǎn)品運回本企業(yè)并最終復(fù)出口的行為。”

取消了對“某道工序進行加工”的限制

相應(yīng)的，《辦法》原第二十五條第（二）項規(guī)定，“經(jīng)營企業(yè)將主要工序外發(fā)加工的”，海關(guān)不予批準(zhǔn)外發(fā)加工業(yè)務(wù)。現(xiàn)刪除了此限制。
對《辦法》作這樣的修改主要是考慮到加工貿(mào)易的品種繁多、且發(fā)展迅速，海關(guān)和企業(yè)對相當(dāng)一部分貨物加工貿(mào)易的“主要工序”認定標(biāo)準(zhǔn)存在較大差異，海關(guān)也沒有明確可執(zhí)行的標(biāo)準(zhǔn)，很難統(tǒng)一執(zhí)法尺度。在實際監(jiān)管中，企業(yè)也經(jīng)常由于申請報批時，海關(guān)難以及時審批而增加生產(chǎn)成本，因此對外發(fā)加工的這種限制在實踐中難以落實。
需要強調(diào)說明的是，此次修改取消了“主要工序”不得外發(fā)加工的限制，不等于放棄或削弱對外發(fā)加工業(yè)務(wù)的監(jiān)管，而是要創(chuàng)新監(jiān)管手段，實行更加嚴(yán)密、有效的監(jiān)管。海關(guān)總署加工貿(mào)易司準(zhǔn)備在實際監(jiān)管工作中，將外發(fā)加工業(yè)務(wù)與深加工結(jié)轉(zhuǎn)業(yè)務(wù)用基本一樣的監(jiān)管方式和同一個監(jiān)管作業(yè)系統(tǒng)進行管理。目前，海關(guān)總署加工貿(mào)易司已著手在H2000深加工結(jié)轉(zhuǎn)子系統(tǒng)中增加對外發(fā)加工業(yè)務(wù)實施監(jiān)管的功能模塊和作業(yè)程序，以保證對外發(fā)加工業(yè)務(wù)的有效監(jiān)管。同時該司也在起草相關(guān)具體的管理規(guī)定，以規(guī)范對外發(fā)加工的管理。因此將《辦法》原二十三條第一款“經(jīng)營企業(yè)經(jīng)海關(guān)批準(zhǔn)可以開展外發(fā)加工業(yè)務(wù)。外發(fā)加工應(yīng)當(dāng)在加工貿(mào)易手冊有效期內(nèi)進行”修改為“經(jīng)營企業(yè)經(jīng)海關(guān)批準(zhǔn)可以開展外發(fā)加工業(yè)務(wù)，并按照外發(fā)加工的相關(guān)管理規(guī)定辦理。”

修改了外發(fā)加工特殊情況的處理原則

即，外發(fā)加工有關(guān)貨物經(jīng)經(jīng)營企業(yè)所在地主管海關(guān)批準(zhǔn)可不運回本企業(yè)。
《辦法》原第二十四條規(guī)定，經(jīng)營企業(yè)應(yīng)當(dāng)將外發(fā)加工的成品、邊角料、剩余料件、殘次品、副產(chǎn)品等加工貿(mào)易貨物運回本企業(yè)。從執(zhí)法實際來看，海關(guān)監(jiān)管存在很大難度，對企業(yè)來說也有諸多不便。例如，當(dāng)外發(fā)加工環(huán)節(jié)產(chǎn)生出大量價值不大或產(chǎn)生有毒有害的邊角料及副產(chǎn)品時，就地處理比較適宜。再如，西部企業(yè)將最后一道工序外發(fā)至東部地區(qū)進行加工時，在加工地辦理出口手續(xù)可以方便企業(yè)，也可以減少海關(guān)監(jiān)管環(huán)節(jié)。
鑒于這些情況，對《辦法》第二十四條進行了修改，規(guī)定外發(fā)加工中的相關(guān)加工貿(mào)易貨物，經(jīng)經(jīng)營企業(yè)所在地主管海關(guān)批準(zhǔn)，可以不運回本企業(yè)。

刪除了“核查”的定義

《辦法》原第三條對“核查”作了定義。由于2008年海關(guān)總署一類立法項目《中華人民共和國海關(guān)保稅核查辦法》將對海關(guān)“保稅核查”進行重新定義，為了避免規(guī)章中相同概念的沖突，本次修改刪除了《辦法》中關(guān)于“核查”含義的解釋。

修改了有關(guān)法律責(zé)任的表述

《辦法》原第四十二條對法律責(zé)任進行了規(guī)定。由于《中華人民共和國海關(guān)行政處罰實施條例》自2004年11月1日起施行，《中華人民共和國海關(guān)行政處罰實施細則》同時廢止，因此將第四十二條修改為：“違反本辦法，構(gòu)成走私行為、違反海關(guān)監(jiān)管規(guī)定行為或者其他違反海關(guān)法行為的，由海關(guān)依照海關(guān)法和《中華人民共和國海關(guān)行政處罰實施條例》的有關(guān)規(guī)定予以處理；構(gòu)成犯罪的，依法追究刑事責(zé)任。”