申請發明專利的，申請文件應當包括：發明專利請求書、摘要、摘要附圖(適用時)、說明書、權利要求書、說明書附圖(適用時)，各一式兩份。
涉及氨基酸或者核苷酸序列的發明專利申請，說明書中應包括該序列表，把該序列表作為說明書的一個單獨部分提交，并與說明書連續編寫頁碼，同時還應提交符合國家知識產權局規定的記載有該序列表的光盤或軟盤。
申請實用新型專利的，申請文件應當包括：實用新型專利請求書、摘要、摘要附圖(適用時)、說明書、權利要求書、說明書附圖，各一式兩份。
申請外觀設計專利的，申請文件應當包括：外觀設計專利請求書、圖片或者照片(要求保護色彩的，應當提交彩色圖片或者照片)以及對該外觀設計的簡要說明，各一式兩份。提交圖片的，兩份均應為圖片，提交照片的，兩份均應為照片，不得將圖片或照片混用。