根據上述職責，省商務廳內設24個職能處室。

（一）辦公室

負責文電、會務、機要、檔案等機關日常運轉工作；承擔信息、安全、保密、信訪、政務公開等工作。

（二）人事教育處

負責廳機關、廳屬單位的機構編制、人事管理、隊伍建設、教育培訓的管理工作；宏觀管理廳屬院校。

（三）綜合處

組織擬訂全省國內外貿易、經濟合作和口岸的發展戰略、規劃；監測分析商務運行狀況，研究商務運行和結構調整中的重大問題，提出相關政策建議；承擔有關統計及信息發布工作；承擔綜合材料起草工作。

（四）政策法規處

起草有關地方性法規草案和規章；研究經濟全球化、區域經濟合作、現代市場體系和現代流通方式的發展趨勢并提出對策建議；研究對外擴大開放、國內外貿易流通體制改革并就重大問題提出意見和建議；承擔廳機關有關規范性文件的合法性審核工作；承辦相關行政復議和行政應訴工作；承擔反壟斷相關工作。

（五）財務處

承擔本廳歸口的業務資金、專項基金等的具體使用和管理工作；編報預決算并下達預算；負責本廳的資產管理、機關財務和內部審計工作。

（六）市場秩序處（省生豬屠宰工作領導小組辦公室）

牽頭協調整頓和規范市場經濟秩序的相關工作；推動商務領域信用建設，指導商業信用銷售，建立市場誠信公共服務平臺；參與組織打擊侵犯知識產權、商業欺詐等工作；負責生豬屠宰管理工作。

（七）市場體系建設處

組織擬訂健全規范市場體系的政策；推進流通標準化；牽頭組織規范零售企業促銷行為；指導大宗產品批發市場規劃和城市商業網點規劃、商業體系建設；推進農村市場和農產品流通體系建設；按有關規定對拍賣、典當、租賃、汽車流通和舊貨流通行業等進行監督管理；指導報廢汽車管理和老舊汽車更新工作。

（八）商貿服務管理處

承擔批發、零售、餐飲、住宿等商貿服務業的行業管理；推動流通體制改革和連鎖經營、商業特許經營、物流配送、電子商務等現代流通方式的發展；指導社區商業和商品會展業發展；提出促進商貿中小企業發展的政策和建議；指導流通領域節能降耗、再生資源回收工作；按有關規定對成品油流通進行監督管理。

（九）市場運行調節處（省繭絲綢協調辦公室）

負責監測分析市場運行和重要商品供求狀況；調查分析商品價格信息，進行市場預測預警和信息引導；承擔建立健全生活必需品市場供應應急管理機制相關工作；承擔重要消費品（肉類、食糖等）儲備管理和市場調控的有關工作；承擔酒類流通管理的相關工作和繭絲綢協調工作。

（十）對外貿易處

執行進出口商品管理辦法和目錄；承擔重要工業品、原材料和重要農產品進出口總量計劃的組織實施工作；編報進出口商品配額、關稅配額年度計劃并組織實施；執行進出口商品配額招標政策；指導交易會、洽談會等貿易促進活動和出口基地等外貿促進體系建設；負責進出口企業經營資格備案工作。

（十一）出口加工區和加工貿易處

擬訂并組織實施我省出口加工區及加工貿易的發展規劃和政策；負責出口加工區的指導協調和審核、報批等工作；審批省屬權限內加工貿易業務；核準企業加工貿易項下引進設備項目；引導加工貿易企業開拓國際市場，推進加工貿易轉型升級。

（十二）服務貿易處

牽頭擬訂全省服務貿易發展規劃；擬訂技術貿易政策和促進服務出口規劃、政策并組織實施；承擔技術進出口管理、服務貿易促進和服務貿易統計工作。

（十三）機電和科技產業處（省機電產品進出口辦公室）

擬訂全省機電產品進出口、高新技術產品進出口、成套設備出口等相關政策；承擔機電產品、高新技術產品貿易促進工作；負責執行國家出口管制政策；協調管理全省進口機電產品招標工作。

（十四）進出口公平貿易和產業損害調查處

負責涉及世貿組織規則的相關工作；組織協調反傾銷、反補貼、保障措施及其他與進出口公平貿易相關工作；建立進出口公平貿易預警機制；指導協調國外對我省出口商品的反傾銷、反補貼、保障措施的應訴及相關工作；承擔產業損害調查工作；建立并完善產業損害預警機制，開展產業競爭力調查、產業安全應對與效果評估；指導協調產業安全應對工作。

（十五）外國投資管理處

擬訂和執行利用外資的管理規章；研究外商投資情況并上報動態和建議；審核外商投資企業的設立及其變更事項、重大外商投資項目合同章程及其法律特別規定的重大變更；依法監督檢查外商投資企業執行有關法律、法規、規章和合同章程的情況并協調解決有關問題；指導外商投資企業審批工作；建立健全外商投資企業的投訴、協調和督辦工作制度，受理、協調、督辦外商投資企業投訴的重大案件，指導和監督全省外商投資企業的投訴工作。

（十六）外國投資促進處（省人民政府開放型經濟辦公室）

參與擬訂并組織實施利用外資的中長期規劃；負責指導外商投資促進、招商引資工作；擬訂利用外資重大招商計劃并組織重大招商活動；協調推進外商投資重大項目；指導省內國家級經濟技術開發區有關工作；會同有關方面擬訂并組織實施促進服務外包發展的規劃、政策，推動服務外包平臺建設。

（十七）國內投資促進處

擬訂利用省外資金政策和發展規劃；負責利用省外資金重大招商活動的組織和落實，協調推進利用省外資金重大項目；研究利用省外資金情況并上報動態和建議；指導省政府駐外機構引進資金和經濟協作業務工作。

（十八）投訴協調處

建立健全外省來江蘇省投資企業的投訴協調和督辦工作制度；受理、協調、督辦外省來江蘇省投資企業的投訴案件；為外省來江蘇省投資企業提供投資政策咨詢和協調服務。

（十九）區域經濟合作處

負責對口支援規劃和組織實施工作；參與區域經濟合作的組織協調工作；負責外省駐江蘇省商會、駐江蘇省辦事機構、江蘇省商聯合會和我省駐外商會、駐外辦事機構的相關協調服務工作。

（二十）對外經濟合作處（省對外經濟聯絡辦公室）

擬訂和組織實施對外經濟合作規劃、政策；審核對外經濟合作企業經營資格，指導和推進對外工程承包、外派勞務合作和設計咨詢等對外經濟合作業務；對赴敏感國家（地區）的承包工程、勞務合作、設計咨詢項目進行登記備案；歸口管理對外援助，負責接受國際多雙邊無償援助業務；制定省內公民出境就業管理政策并組織實施；承擔外派勞務和境外就業人員的權益保護相關工作。

（二十一）對外投資處

擬訂和組織實施對外投資政策及管理規章；依法核準、推進省內企業在境外投資開辦企業（金融企業除外）；負責對外直接投資統計工作。

（二十二）空港口岸管理處（省口岸管理辦公室）

擬訂和組織實施口岸發展規劃、政策；負責航空、水運口岸（含作業區、特殊監管區等）的申報、建設、驗收和管理；開辟國際國內航空、水運航線通道； 協調或仲裁相關部門之間的口岸事務，推動口岸文明共建。

（二十三）陸路口岸管理處

負責鐵路、公路口岸（含作業區、特殊監管區等）的申報、建設、驗收和管理；開辟鐵海聯運及公路口岸運輸通道，發展口岸物流；推進口岸區域'大通關'合作；負責電子口岸的規劃、建設工作。

（二十四）外事處

擬訂廳外事工作制度；承擔有關外事工作。

離退休干部處 負責機關離退休干部工作，指導廳屬單位離退休干部工作。

直屬機關黨委 負責廳機關和廳屬單位的黨群工作。

紀檢組（監察室） 為省紀委（省監察廳）的派駐機構。