全椒縣商務局主要職能：

(一)貫徹執行國家、省關于內外貿易、國際經濟合作和外商投資的方針、政策和法律、法規。

(二)研究擬定全縣內外貿易發展戰略、中長期規劃、年度計劃和相應政策并組織實施。
(三)分析國際貿易形勢和我縣進出口狀況，提出總量平衡、結構調整等宏觀調控建議；管理國家和省級國內外貿易、國際經濟合作和利用外資的各項促進資金。
(四)協調、指導全縣進出口業務，開展政策和市場研究，指導企業對外宣傳工作。組織和協調交易會、洽談會等大型經濟貿易促進活動；指導全縣商貿領域內信息網絡、電子商務、電子政務建設；負責全縣內外貿企業的人才培訓工作。
(五)統籌管理本縣商品進出口和技術貿易工作，協助滁州市做好進出口商品配額申報以及全縣各類進出口企業的出口退稅稽查，加工貿易合同的管理，指導全縣機電產品進出口工作及對外貿易促進工作。宏觀指導全縣外商投資工作；分析、研究全縣外商投資情況，審理、轉報限額以上、限制投資和涉及配額、許可證管理的外商投資企業的設立；審批權限范圍內的外商投資項目的合同、章程及其變更，核發批準證書；監督檢查外商投資企業執行有關法律法規和合同、章程的情況；指導和管理全縣利用外資和外商投資企業的進出口工作；牽頭協調外商投資企業聯合年檢工作。
(六)負責全縣對外經濟合作，管理全縣對外承包工程、勞務合作、設計咨詢等業務；組織接受外援，負責受援項目的對外工作和縣內實施，參與組織援外工作；管理多、雙邊對我縣無償援助及贈款；管理聯合國和有關國家組織對我縣經濟技術合作事務；參與對外利用外國政府貸款項目有關工作的管理。
(七)負責涉及世貿組織相關事務的研究、指導和服務工作；組織協調反傾銷、反補貼、保障措施及其他與進出口公平貿易相關的工作；組織產業損害調查；指導和協調國外對我縣出口商品的反傾銷、反補貼、保障措施的應訴及相關工作。
(八)規劃和指導我縣出口商品基地建設，推動我縣外資企業、自營生產企業的發展，在企業集團化的基礎上，走向國際化。
(九)研究提出流通體制改革意見，擬定商品流通物流配送、重點設施的布局規劃，推進流通產業結構調整，推廣連鎖經營、物流配送、電子商務等現代流通方式，負責商品流通的行業管理、檢測，分析市場運行和商品供求狀況，負責重要消費品市場和政府儲備的組織實施，制定市場應急預案，促進城鄉市場的發展。
(十)研究擬定本縣生活服務業重大設施布局規劃并組織實施。協調商業中心、特色商業部門和各類商品交易市場的規劃與建設，負責生活服務業的行業管理。
(十一)負責組織整頓和規范市場經濟秩序工作、會同有關部門加強流通領域商品質量、計量和標準的監督檢查，負責本縣繭絲綢、成品油、潤滑油、煤炭、酒類的管理工作；負責拍賣、典當、生豬屠宰、舊貨流通、實物租賃、報廢汽車回收、舊機動車交易等管理工作。