學生創業中心管理服務中心以正規化公司制經營，設立五個部門：

n行政部：負責制定創業中心各類規章制度；管理學生創業中心的財產物資及網絡平臺；管理檔案、編訂年冊；管理日常開支、統計學生創業中心入駐公司財務量化信息等。

n人事部：負責建立健全學生管理服務中心人力資源管理制度包括招聘、培訓、績效考評、獎懲制度及人員調動，并負責中心員工成長體系，以及中心的企業文化建設。

n咨詢部：對進駐學生創業中心的各公司進行業務及運營的監督管理與服務；以一學年為周期開展各類課題的創業教育調研；為所有有志于創業的大學生提供創業咨詢。

n市場部：負責為學生創業中心爭取并提供更多更好的校內和校外的資源，聯系并邀請企業家和創業者參加創業沙龍，創業課程，財經熱點討論等活動，并負責對外走訪，市場調研，信息反饋及各類社會資源和沙龍會員維護

n企宣部：負責中心CIS系統（企業形象識別系統）的建立維護，對中心各項品牌活動進行包裝及宣傳推廣；撰寫宣傳文案、制作海報視頻等宣傳用品、活動主持、后期新聞稿發布、公共網絡平臺管理、媒體及各高校相關組織間的聯絡及公共關系維護。