基本規定
　　出口企業以“進料加工”貿易方式減稅進口原材料、零部件轉售給其他企業加工時，應先填具“進料加工貿易申報表”（格式見附件四），報經主管其出口退稅的稅務機關同意簽章后再將此申報表報送主管其征稅的稅務機關，并據此在開具增值稅專用發票時可按規定稅率計算注明銷售料件的稅額，主管出口企業征稅的稅務機關對這部分銷售料件的銷售發票上所注明的應交稅額不計征入庫，而由主管退稅的稅務機關在出口企業辦理出口退稅時在退稅額中扣抵。
　　出口企業開展進料加工業務，應按照《海關總署、國家稅務總局關于加強協調配合嚴格出口退稅報關單管理和加強防偽鑒別措施的聯合通知》（署監〔1996〕32號）中第七條的規定，須先持外經貿主管部門的批件，送主管其出口退稅的稅務機關審核簽章，稅務機關須逐筆登記并將復印件留存備查。海關憑蓋有主管出口退稅的稅務機關印章的經貿主管部門的批件，方能辦理進口料件“登記手冊”；加工的貨物出口后，按照下列的規定計算退稅。對事先未到稅務機關審核簽章而以“進料加工”名義出口的貨物，凡屬于生產企業出口的，一律按照財稅字〔1995〕92號文件中第三條、第五條規定的公式計算退稅；凡屬于外貿企業出口的，其保稅進口的原材料、零部件轉售給其他企業加工時，應按規定的增值稅稅率計征銷售料件的增值稅。
　　計稅依據及計算方法
　　外貿企業進料加工復出口的貨物，按下列公式計算退稅：
　　出口退稅額＝出口貨物的應退稅額－銷售進口料件的應交稅額
　　銷售進口料件的應交稅額＝銷售進口料件金額×稅率－海關已對進口料件的實征增值稅稅款
　　外貿企業從事的進料加工復出口貨物，主管退稅的稅務機關在計算抵扣進口料件稅額時，凡進口料件征稅稅率小于或等于復出口貨物退稅稅率的，按進口料件的征稅稅率計算抵扣；凡進口料件征稅稅率大于復出口貨物退稅稅率的，按復出口貨物的退稅稅率計算抵扣。
　　生產企業以“進料加工”貿易方式進口料件加工復出口的，對其進口料件應先根據海關核準的《進料加工登記手冊》填具“進料加工貿易申請表”，報經主管其出口退稅的稅務機關同意蓋章后，再將此申請表報送主管其征稅的稅務機關，并準許其在計征加工成品的增值稅時對這部分進口料、件按規定征稅稅率計算稅額予以抵扣。貨物出口后，主管退稅的稅務機關在計算其退稅或抵免稅額時，也應對這部分進口料件按規定退稅率計算稅額并予扣減。
　　計算公式為：當期不予抵扣或退稅的稅額＝當期出口貨物離岸價×外匯人民幣牌價×（征稅稅率－退稅率）－當期海關核銷免稅進口料件組成計稅價格×（征稅稅率－退稅率）
　　出口貨物退稅率調整后，進料加工復出口貨物按新退稅率計算須從退稅款中抵扣的應征增值稅稅款的執行時間，外貿企業以銷售料件的增值稅專用發票上注明的時間為準，生產企業以進料加工貿易中報表中申報時間為準。