（一）手冊核銷
1.加有企業簽章及經外經貿主管部門審批的《加工貿易合同核銷申請表》（正本，一式兩份）；
2.《加工貿易合同核銷料件耗用量分表》（正本，一式兩份）；
3.保稅貨物內銷補稅報關單(正本)、稅單（核正本、留復印件）；
4.保稅貨物內銷補稅報關單（正本）、稅單（核正本、留復印件）；
5.因涉案被查處，企業已被追繳違法所得或責令補稅的，須收取辦案部門出具的《處罰決定書》、繳款單或稅單正本及復印件（核正本、留復印件）；
6.對進行委托加工業務的企業，須收取“委托加工申請表”及雙方交接貨單據（正本，可在清單使用表上注明單據票數）；
7.如手冊涉及國內購料的，企業須提供國內購料發票原件及復印件；
8.海關認為必要的其他單證。
（二）設備解除監管
1.《海關監管設備及自用物品解除監管申請表》及《設備明細表》（正本，一式二份）；
2.進口報關單（核正本，收復印件），若遺失報關單的，應收取經營企業提供的遺失報關單書面報告；
3.《協議手冊》或批文、進口設備《基本情況登記冊》；外商投資企業還需收取《進口設備征免稅證明》（核正本，收復印件）；
4.對1998年1月1日后進口的加工貿易項下外商提供的不作價設備，企業申請提前解除監管或監管期限已滿轉廠使用的，企業需提供申請轉廠使用的書面報告、由機電產品進口管理機構簽發的批件（進口時已辦理過舊電機產品進口手續的舊設備除外）及檢驗檢疫部門對設備安全、環保、衛生等項目檢驗檢疫合格后簽發的《檢驗檢疫證書》，屬提前解除監管的還需提供設備折舊補稅的報關單及稅單原件、復印件（核原件、留復印件）；監管期限已滿留廠使用的，企業需提供留廠使用的書面報告，可免于提供上述批件和《檢驗檢疫證書》；
5.海關認為必要的其他單證。
（三）來料加工協議終止
1.經外經貿主管部門批準的協議終止批文（正本，一式三份）；
2.企業填報的《來料加工協議終止呈批表》（正本，一式三份）；
3.企業填報的《進口設備及自用物品處理清單》（正本，一份）；
4.《基本情況登記手冊》、《協議手冊》（正本）；
5.設備進出口報關單及清單；對進口設備及自用物品已解除海關監管的，須收取已解除監管的海關證明（核正本，存復印件）；
6.對已折舊補稅的進口設備，須收取保稅貨物內銷補稅報關單（正本）及稅單復印件（核正本，存復印件）；
7.經海關批準后已作其他處理的設備及自用物品，需收取海關批件（核正本，存復印件）；
8.收取海關認為必要的其他單證。
（四）外商投資企業終止
1.外經貿部門關于企業終止的批文（正本，一式三份）；
2.《進出口貨物征免稅證明》（核正本、存復印件）；
3.企業填報的《外商投資企業終止呈批表》（正本，一式三份）；
4.企業填報的《進口設備及自用物品清單》（正本，一份）；
5.設備進出口報關單及清單；
6.對進口設備已解除海關監管的，須收取海關解除監管的證明（核正本，留復印件）；
7.對已折舊補稅的進口設備，須收取保稅設備內銷補稅報關單正本及稅單復印件（核正本，存復印件）；
8.經海關批準作其他處理的設備，須收取海關批準證明；
9.收取海關認為必須提供的其他單證。
（五）加工貿易保稅料件征稅內銷
1.企業填報的《加工貿易貨物內銷征稅聯系單》（正本，一式三份）；
2.經外經貿主管部門核發的《加工貿易保稅進口料件內銷批準證》正本及復印件（核正本，存復印件）；，如內銷征稅的加工貿易料件價值在人民幣一萬元以內且內銷料件價值在合同料件價值的3％以內的，免收《加工貿易保稅進口料件內銷批準證》；
3.加工貿易貨物進口報關單復印件。
（六）邊角料、殘次品、副產品、受災保稅貨物征稅內銷
1.企業填報的《邊角料、殘次品、副產品受災保稅貨物征稅申請表》（正本，一式二份）；
2.加工合同備案情況表復印件、成品對應料件單損耗情況復印件及核銷表復印件；
3.殘次品折回所耗用的料件后，如料件價值在人民幣一萬元以內且在合同料件總價值的3％以內的，免收《加工貿易保稅進口料件內銷批準證》，否則應要求企業提供《加工貿易保稅進口料件內銷批準證》；
4.受災保稅貨物申請內銷的，應收取企業報告、保險公司或檢驗檢疫部門出具的證明。
（七）不作價設備內銷審核
1.企業填報并加蓋印章的《設備內銷申請表》（正本，一式二份）；
2.商檢部門核發的《檢驗檢疫證書》正本及復印件（核正本、留復印件）；
3.設備進口報關單正本及復印件（核正本、留復印件）。
（八）減免稅設備內銷
1.企業填報并加蓋印章的《設備內銷申請表》（正本，一式二份，東莞市外經主管部門加注審批意見并蓋章）；
2.設備進口報關單正本及復印件（核正本、留復印件）。
（九）加工貿易料件及邊角料退港
1.加工合同備案情況表復印件、成品對應料件單損耗情況復印件；
2.企業填報并加蓋印章的《企業（生產計劃）料件退港申請表》（正本，一式三份，須由東莞市外經主管部門加注審批意見并蓋章）。
（十）修理物品維修申請
1.企業填報并加蓋印章的《返工復出申請表》（正本，一式三份）；
2.已經核銷結案的《核銷申請表》（正本，一式一份）。
（十一）確認來料加工變更商人、商號、廠址的企業執行情況
1.企業填報并加蓋印章的《來料加工變更商人、商號、廠址聯系單》（正本，一式二份）；
2.外經部門同意變更的審批表（正本）。
（十二）超期收本
1.企業填報并加蓋印章的《超期合同收簿、掛帳申請表》（正本，一式二份）；
2.加工貿易備案手冊正本；
3.企業證明收簿申請原因的有關文件。
（十三）超期合同掛帳
1.企業填報并加蓋印章的《超期合同收簿、掛帳申請表》（正本，一式二份）；
2.加工貿易備案手冊正本；
3.企業證明掛帳申請原因的有關文件；
（十四）臺帳超期刪除臺帳
1.企業提供并加蓋印章的臺帳超期報告；
2.已經核銷結案的《核銷表》正本。
（十五）聯網監管電子賬冊預報核
《加工貿易電子帳冊預報核申請表》（一式三份）。
（十六）聯網監管電子賬冊正式報核
1.已經海關審核通過的《加工貿易電子帳冊預報核申請表》一份；
2.經外經貿主管部門審核的《加工貿易電子帳冊正式報核申請表》一式兩份；
3.紙質報關單（正本）、內銷補稅稅單（核正本，存復印件）；
4.海關簽發的本核銷周期內到期的異地報關紙質分冊；
5.海關認為必要的其他資料。
（十七）聯網監管手冊核銷
1.《登記手冊》（包括續本及分冊）（正本）；
2.經報關行預錄入后打印的《加工貿易合同核銷預錄入表》（正本，一份）；
3.加工貿易企業遺失《登記手冊》的，須收取關于手冊遺失的書面報告、在省級以上刊物登報聲明的遺失聲明復印件、《加工貿易企業遺失<登記手冊>布控聯系通知單》復印件、《東莞海關關于請協助對遺失<登記手冊>的加工貿易企業布控的函》復印件，如屬被劫、被盜的要提交公安部門證明。
（十八）邊角料內銷歸類審價
正常情況不需企業提供任何單證，但以下兩種情況除外：
1.如需向關稅處咨詢商品價格及歸類時，企業應提供以下單證資料：
（1）所詢商品的有關描述說明書；
（2）所詢商品的圖片或少量樣板；
（3）電子申報單白單；
（4）代理委托書（報關組/行代理時提供）；
（5）商檢機構出具的商品檢驗證明書（需商檢時提供）。
2.如果企業認為關稅處答復的價格過高，要求價格磋商時，還需提供以下單證資料：
（1）國內有資質的價格鑒證機構出具的評估證明；
（2）企業過往處理類似邊角料的商業憑證所反映的價格資料。
（十九）料件內銷審價、設備審價
合同或銷售確認書、發票（含原廠發票）、裝箱單、運費單、保費單（保費協議、發票）、銀行單證（信用單證等）（付匯方式為電匯時不用提供）、商檢證、原產地證、付匯單證、代理委托書、原進口報關單、加工貿易內銷征稅聯系單、內銷批準證、貨物說明書、其他單證。