海關為簡化手續，提高工作效率，體現促進與服務生產的方針，根據不同的企業和商品分別采取信任核銷、一般核銷和重點核銷等方法進行核銷：

　①信任核銷。是指海關對守法經營，單證齊全，合同執行情況正常，沒有違反海關臨管規定，可允許由經海關培訓認可的企業和自管小組自行核銷。核銷后的合同、“登記手冊”和單證等應及進送交海關存檔。海關除對核銷結果保留抽查權外，一般不再核對。

　②一般核銷也稱單證核銷。是指海關對進口料件和出口成品不涉及國家許可管理，保稅金額不大，有準確的耗料定額，沒有走私違規嫌疑的，可采取一般核銷。該方法通常無需下廠核查有關實物和倉儲、帳冊等，海關只對有關單證、帳冊進行證面核對，企業只需提供有關資料、樣板等，配合海關完成核銷工作。：

　③重點核銷。它是一種單證核對與下廠核量相結合的一種方式。主要適用于信譽不好、有走私違規嫌疑的企業，或海關在某段時間內需要作為重點監管的商品。此方式要求企業向海關提供詳細的進口料件、存儲、保管、提取使用和出口成品的存儲、出口銷售帳冊，以及相關的商業來往函電、加工工藝流程圖等，并為海關下廠核查實物、倉儲、帳冊等提供方便

　核銷中遇有下列情況，應主動向海關辦理有關手續：

　①需要辦理征、減、免稅手續的。一是加工完畢后，剩余的的邊角料件，可免領進口貨物許可證，由海關按其實際使用價值估價征稅或酌情減免稅，企業按海關規定納稅或免稅。二是加工企業按合同規定對外履約后，由于改進生產工藝和心頭經營管理而剩余的料件；或增產的成品，經原審批機關批準轉為內銷，海關核準屬實的，其價值在進口料件總值2以內并且總價值在人民幣3000元以下的，可免領進口貨物許可證和免稅，其超過部分，免領進口貨物許可證，按料件納稅。三是合同項下進口料件和加工成品，因故要求轉內銷，或因外商單方面中止合同，加工單位要求以所存料件或加工成品內銷以抵償工繳費的，經原審批機關批準和海關核準后，按一般進口貨物的規定向海關辦理進口手續，其中涉及應稅商品的，照章納稅，屬國家許可證管理商品的，還應申領進口貨物許可證。

　②將半成品轉讓加工的。進口料件加工裝配后不直接出口，而是轉讓給加一承接進口料件加工成品復出口的加工單位進行再加工裝配的，由轉讓料件的單位會同接受轉讓的加工單位持憑雙方簽訂的購銷或委托加工合同等有關單據向海關辦理結轉和核銷手續。

　③需要中止、延長或轉讓合同的。企業因特殊情況，需中止、延長或轉讓某全合同時，應向審批機關申請批準后10天內，向合同主管海關報告，經同意后，方可執行。

　核銷完畢，企業向海關領取加工裝配“核銷清表”，并按海關規定處理合同項下進口的機器設備。

辦理報關手續

（1）申報。報關員持以下單證向海關申報進出口貨物；①進出口貨物報關單（綠綠色）一式4份；②"對外加工裝配進出口貨物登記手冊"；③有關運輸單據，如提單、載貨清單、裝箱單、磅碼單等；④出口外匯核銷單。

（2）接受查驗。根據《海關法》規定，海關查驗貨物時，報關員應到場并負責搬移貨物、拆和重封貨物包裝。

（3）辦理繳納稅費手續。遇下列情形之一的，免征進口稅；①加工裝配合同項下進口用于加工成品復出口的料件；②加工裝配合同項下進口，直接用于企業加工生產出口產品，而在生產過程中消耗掉的燃料油，以及加工企業生產自用發電油；③進口合理數量的用于安裝、加固機器設備的材料；④為加強工業生產管理，由外商提供進口的微型計算機、閉路電視監視系統、電話機等管理設備。

有下列情況之一的，按章征收進口稅費；①為加工生產進口的辦公用品；②超出海關規定免征進口稅范圍的加工貿易貨物；③加工裝配合同項下進口料件、設備等按規定繳交海關監管手續費。

（4）按受放行。企業妥申報、按受查驗和繳納稅費手續，并領取了海關簽章的報關單核銷聯后，可將貨物運離海關監管現場。

合同登記備案

（1）申請合同備案。報關員應在對外簽訂的來料加工合同自批準之日起1個月內持下列單證向海關申請辦理合同登記備案手續。
①國家外經貿主管部門批準企業成立的文件；②海關頒發的《報關注冊證明書》；
③經營單位的公章、報關專用章、合同章和更改章等印模及報關員證件的復印件；
（以上為首次開展來料加工業務企業必須遞交的單證）；④審批部門的批準文件或合同備案證明書（如需以外貿易經濟合作部批準立項的項目，還應提供外經貿部批準立項的文件）；
⑤加工單位或外貿（工貿）公司的營業執照；⑥稅務機關簽發的稅務登記證；
⑦對外簽訂的正式合同副本和料件清單、耗料定額等；⑧申請單位向海關購買后填寫的簽章的"對外加工裝配進出口貨物登記手冊"；
⑨海關認為必要的其他單證如保函。

（2）接受審核。加工企業應接受海關對其單證及加工場所、設備等的審核和勘察，特別是首次申請開辦加工裝配業務，或開展當前敏感性商品加工項目的企業，應該向海關詳細介紹企業生產能力、加工工藝、生產組織形式、經營決策機制和企業會計帳冊制度等企業基本情況，以便海關對企業的資信進行評估，為海關分類管理企業提供依據。

（3）領取"登記手冊"。合同登記備案的目的是為了最后取得通關資格。因此，凡被確認為符合國家政策規定，符合海關監管要求的合同，均可向海關領取已蓋主管海關合同備案專用章及手冊編號的“對外加工裝配進出口貨物登記手冊”。報關員憑此手冊向口岸海關辦理加工裝配合同項下料件、設備進口和加工成品出口通關手續。報關員應妥善保管"登記手冊"，如有遺失，應及時向主管海關報告，并將有關原進出口貨物的單證交主管海關，經海關核查情況屬實的，予以補發。在海關補發"登記手冊"前，有關貨物不得進出口。